Trafikstyrelsen arbejder for at optimere rammerne for en sikker og sammenhængende (interoperabel) jernbane i vækst. Som led i dette fører Trafikstyrelsen blandt andet tilsyn med jernbanevirksomhederne og jernbaneinfrastrukturforvalterne og godkender disses rullende materiel og infrastruktur.
En stigende andel af reglerne for jernbanebranchen kommer fra EU. Trafikstyrelsen deltager aktivt i EU-samarbejdet og er med til at udvikle de fælles regler og repræsentere danske interesser.
Fremadrettet arbejder Trafikstyrelsen med at udvikle en sammenhængende regulering, der håndterer grænsefladerne mellem eksisterende regelsæt og EU-reglerne og tilgodeser sektorens mulighed for at innovere og effektivisere.